海峡股权交易中心经福建省政府批准设立，由福建省金融工作办公室负责监管，遵循中国证监会对中国多层次资本市场体系建设的统一要求，是福建省贯彻落实国务 院支持海西先行先试的“三规划两方案”、建设两岸区域性金融服务中心的重大举措，是中国多层次资本市场体系建设重要环节和有机组成部分。

　　海峡股权交易中心于2011年10月26日在两岸共同家园——福建省平潭综合实验区注册成立，2013年7月18日正式开业运营，现注册资本2.1亿元，共有兴业证券、福建省能源集团、福建省产权交易中心、北京市投资管理公司等地市国有投资机构以及有台资背景的海峡富国基金等10家股东。